L\u2019apparition du syndrome respiratoire aigu s\u00e9v\u00e8re du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) \u00e0 Wuhan, dans la province du Hubei en Chine, a rapidement men\u00e9 \u00e0 la pand\u00e9mie de COVID-19. En date du 21 d\u00e9cembre 2020, plus 75 millions de cas ont \u00e9t\u00e9 confirm\u00e9s dans le monde selon l\u2019Organisation mondiale de la Sant\u00e9 (OMS).<\/p>\n\n\n\n
En raison de la sensibilit\u00e9 \u00e9lev\u00e9e du COVID-19 \u00e0 l\u2019amplification exponentielle des mol\u00e9cules d\u2019ARN, L\u2019amplification en cha\u00eene par polym\u00e9rase \u00e0 transcriptase inverse en temps r\u00e9el (TR-PCR) ou PCR quantitative est g\u00e9n\u00e9ralement utilis\u00e9e pour confirmer le diagnostic clinique de laCOVID-19.. Bien que les s\u00e9quences g\u00e9nomiques du SRAS-CoV-2 aient \u00e9t\u00e9 enti\u00e8rement r\u00e9v\u00e9l\u00e9es et que les trousses de TR-PCR aient \u00e9t\u00e9 largement utilis\u00e9es, de nombreux d\u00e9fis entravent la d\u00e9tection de la COVID-19, comme la diff\u00e9rence de sensibilit\u00e9 entre les diff\u00e9rentes trousses et les \u00e9tapes de traitement d\u2019\u00e9chantillons chronophages. Une des conditions pr\u00e9alables importantes pour une m\u00e9thode RT-PCR efficace est d\u2019avoir une extraction quantitative des acides nucl\u00e9iques avec une excellente puret\u00e9 \u00e0 partir d\u2019\u00e9chantillons complexes. Une faible efficacit\u00e9 d\u2019extraction d\u2019acide nucl\u00e9ique pourrait donner de mauvais signaux pendant l\u2019amplification exponentielle, ce qui pourrait conduire \u00e0 des r\u00e9sultats faussement n\u00e9gatifs.<\/p>\n\n\n\n
Dans le diagnostic actuel du SRAS-CoV-2, les m\u00e9thodes d\u2019extraction d\u2019ARN de colonnes de centrifugation \u00e0 base de silice sont couramment utilis\u00e9es. Les acides nucl\u00e9iques sont li\u00e9s \u00e0 une fibre de verre ou \u00e0 une membrane de silice. Dans ces m\u00e9thodes classiques, des tampons appropri\u00e9s sont utilis\u00e9s pour pr\u00e9-lyser les \u00e9chantillons afin de lib\u00e9rer les acides nucl\u00e9iques des particules virales avant de les lier \u00e0 la membrane de la colonne. Plusieurs \u00e9tapes de centrifugation sont obligatoires pour faciliter la liaison, le lavage et l\u2019\u00e9lution des acides nucl\u00e9iques extraits.<\/p>\n\n\n\n
En outre, plusieurs \u00e9tapes de lavage s\u00e9quentiel doivent \u00eatre effectu\u00e9es pour \u00e9liminer les effets inhibiteurs possibles de la PCR dans les produits \u00e9lu\u00e9s parce que diff\u00e9rents solvants organiques toxiques et sels chaotropiques corrosifs sont g\u00e9n\u00e9ralement trouv\u00e9s dans les \u00e9tapes de lyse et de liaison. Ces \u00e9tapes multiples de centrifugation et de transfert de colonne sont fastidieuses, laborieuses et expos\u00e9es au risque de contamination ou de colmatage de la colonne. De plus, un fonctionnement automatis\u00e9 \u00e0 haut d\u00e9bit ne peut pas \u00eatre effectu\u00e9 en utilisant des approches \u00e0 colonne de centrifugation. Par cons\u00e9quent, des m\u00e9thodes d\u2019extraction d\u2019acide nucl\u00e9ique fiables, pratiques, rapides et automatis\u00e9es sont hautement n\u00e9cessaires pour d\u00e9tecter la COVID-19.<\/p>\n\n\n\n
Les m\u00e9thodes d\u2019extraction \u00e0 base de nanoparticules magn\u00e9tiques<\/strong><\/a>, comme celle que Galenvs Sciences<\/strong> produit sont une alternative aux m\u00e9thodes d\u2019extraction traditionnelles car cette m\u00e9thode d\u2019extraction se fait sans centrifuge, est facile \u00e0 utiliser et est compatible avec des essais \u00e0 haut d\u00e9bit et d\u2019automatisation. En raison de la pr\u00e9sence de diff\u00e9rents groupes fonctionnels modifi\u00e9s en surface, les acides nucl\u00e9iques dans les \u00e9chantillons lys\u00e9s peuvent \u00eatre sp\u00e9cifiquement absorb\u00e9s sur des nanoparticules magn\u00e9tiques en utilisant des m\u00e9thodes d\u2019extraction conventionnelles \u00e0 base de nanoparticules magn\u00e9tiques. Les champs magn\u00e9tiques permettent une s\u00e9paration rapide des acides nucl\u00e9iques de la plupart des impuret\u00e9s du surnageant. Apr\u00e8s un lavage rapide visant \u00e0 \u00e9liminer les traces d\u2019impuret\u00e9s, les acides nucl\u00e9iques purifi\u00e9s peuvent \u00eatre lib\u00e9r\u00e9s de la surface des nanoparticules magn\u00e9tiques via un tampon d\u2019\u00e9lution avec une force ionique modifi\u00e9e.<\/p>\n\n\n\n Dans une r\u00e9cente \u00e9tude r\u00e9volutionnaire,Zhao and Colleagues ont indiqu\u00e9 que la synth\u00e8se de nanoparticules magn\u00e9tiques enrob\u00e9es de poly (ester amin\u00e9) avec des groupes carboxyles (PC)-enduits (pcMNPs) peut extraire efficacement l\u2019ARN viral, aidant \u00e0 concevoir une m\u00e9thode de d\u00e9tection sensible pour le SRAS-CoV-2 (Zhao et coll., 2020). Cette m\u00e9thode d\u00e9pend de la combinaison de la lyse et des \u00e9tapes de liaison en une seule \u00e9tape, facilitant les complexes pcMNPs-RNA pour passer directement dans le processus RT-PCR suivant. En seulement 20 minutes, l\u2019ARN viral<\/a> peut \u00eatre purifi\u00e9 \u00e0 partir de plusieurs \u00e9chantillons en utilisant une approche automatis\u00e9e \u00e0 haut d\u00e9bit ou une m\u00e9thode manuelle simple. Ils ont obtenu une sensibilit\u00e9 de 10 copies et une forte corr\u00e9lation lin\u00e9aire entre 10 et 105 copiesde particules de pseudo virus du SRAS-CoV-2 en identifiant deux r\u00e9gions diff\u00e9rentes (g\u00e8ne<\/em>Net ORFlab)<\/em>de l\u2019ARN du SRAS-CoV-2.<\/p>\n\n\n\n Cette m\u00e9thode d\u2019extraction r\u00e9volutionnaire aidera \u00e0 r\u00e9duire consid\u00e9rablement les d\u00e9lais d\u2019ex\u00e9cution et les exigences op\u00e9rationnelles dans les m\u00e9thodes actuelles de diagnostic mol\u00e9culaire de la COVID-19, en particulier pour le diagnostic clinique pr\u00e9coce gr\u00e2ce \u00e0 ses performances simples et excellentes.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" L\u2019apparition du syndrome respiratoire aigu s\u00e9v\u00e8re du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) \u00e0 Wuhan, dans la province du Hubei en Chine, a rapidement men\u00e9 \u00e0 la pand\u00e9mie de COVID-19. 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