{"id":282,"date":"2020-12-29T17:45:18","date_gmt":"2020-12-29T17:45:18","guid":{"rendered":"https:\/\/galenvs.com\/?post_type=news-articles&#038;p=282"},"modified":"2023-08-13T11:58:13","modified_gmt":"2023-08-13T11:58:13","slug":"covid-19-what-we-know-about-the-new-variant","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/2020\/12\/29\/covid-19-what-we-know-about-the-new-variant\/","title":{"rendered":"COVID-19 : ce que nous savons sur le nouveau variant"},"content":{"rendered":"\n<p><em>Le virus \u00e0 l\u2019origine de la COVID-19, le SRAS-CoV-2, est un type de coronavirus, une grande famille de virus portant ce nom en raison des pointes \u00e0 leur surface faisant penser \u00e0 une couronne. Le SRAS-CoV-2 est un grand virus d\u2019ARN compos\u00e9 d\u2019environ 30 000 nucl\u00e9otides. Une caract\u00e9ristique des virus ARN est leur impr\u00e9cision relative dans le processus de r\u00e9plication. Par cons\u00e9quent, chaque nouvelle copie peut pr\u00e9senter des mutations stochastiques. Si la nouvelle mutation favorise le virus au sein de l\u2019h\u00f4te ou a un avantage concurrentiel sur les autres souches d\u00e9j\u00e0 en circulation, elle pourrait devenir la forme dominante. C\u2019est ce qui se passe au Royaume-Uni (UK) o\u00f9 un variant d\u00e9tect\u00e9 pour la premi\u00e8re fois le 20 septembre 2020 est apparu et est d\u00e9j\u00e0 la forme la plus r\u00e9pandue dans le pays.<\/em><\/p>\n\n\n\n<p>\u00c0 l\u2019heure actuelle, ce nouveau variant est appel\u00e9e \u00ab SARS-CoV-2 VUI 202012\/01 \u00bb (c.-\u00e0-d. variant faisant l\u2019objet d\u2019une enqu\u00eate depuis d\u00e9cembre 2020). Des termes comme \u00ab variant \u00bb, \u00ab souche \u00bb et \u00ab mutation \u00bb sont utilis\u00e9s de fa\u00e7on interchangeable par la presse et la communaut\u00e9 scientifique. Le variant est aussi souvent appel\u00e9e B.1.1.7 du nom de son groupe phylog\u00e9n\u00e9tique distinct.<\/p>\n\n\n\n<p>VUI 202012\/01 a \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9 pour la premi\u00e8re fois par s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome viral \u00e0 Londres et dans le sud-est de l\u2019Angleterre. Ce variant se distingue par de multiples mutations de la prot\u00e9ine de transitoire (d\u00e9l\u00e9tion 69-70, d\u00e9l\u00e9tion 144, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H) ainsi que par des mutations dans d\u2019autres r\u00e9gions g\u00e9nomiques. La mutation la plus courante de ce variant, N501Y, est sur la prot\u00e9ine de pointe responsable de l\u2019infection des cellules humaines.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Pourquoi ce variant est-il plus transmissible ?<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Il est fr\u00e9quent de voir plusieurs variantes du m\u00eame virus; c\u2019est pourquoi nous avons un vaccin antigrippal diff\u00e9rent chaque ann\u00e9e. Les nouvelles souches ne signifient pas que le virus est plus nocif, et il n\u2019y a actuellement aucune preuve que cette variante provoque une maladie plus grave ou une mortalit\u00e9 plus \u00e9lev\u00e9e. Nous savons aussi que la mortalit\u00e9 est un indicateur retard\u00e9, qui devra \u00eatre \u00e9valu\u00e9 au cours des prochaines semaines. Toutefois, les donn\u00e9es actuelles montrent que les taux d\u2019infection dans les zones g\u00e9ographiques o\u00f9 le VUI 202012\/01 circule ont augment\u00e9 plus rapidement que pr\u00e9vu, et la preuve de mod\u00e9lisation a d\u00e9montr\u00e9 que ce variant a un taux de transmission plus \u00e9lev\u00e9 que les variantes r\u00e9pandues actuellement. Les raisons pour lesquelles cela se produit peuvent \u00eatre multiples.<\/p>\n\n\n\n<p>B.1.1.7 pr\u00e9sente un nombre exceptionnellement \u00e9lev\u00e9 de mutations, en particulier sur la prot\u00e9ine transitoire. Trois de ces mutations ont des effets qui pourraient expliquer le taux plus \u00e9lev\u00e9 de transmission de la variante :<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>La mutation N501Y se produit dans l\u2019un des six principaux r\u00e9sidus du domaine de liaison des r\u00e9cepteurs (RBD) et a \u00e9t\u00e9 d\u00e9crite comme ayant une affinit\u00e9 de liaison croissante avec le r\u00e9cepteur ACE2 humain et murin (le r\u00e9cepteur d\u2019entr\u00e9e pour le virus).<\/li>\n\n\n\n<li>La d\u00e9l\u00e9tion de prot\u00e9ine de pointe 69-70 del conduit \u00e0 un changement conformationnel dans la prot\u00e9ine de pointe, qui s\u2019av\u00e8re augmenter l\u2019\u00e9vasion \u00e0 la r\u00e9ponse immunitaire humaine.<\/li>\n\n\n\n<li>La mutation P681H est adjacente au site de clivage des furines S1\/S2, un site o\u00f9 la variabilit\u00e9 des coronavirus est \u00e9lev\u00e9e.<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p>Cette affinit\u00e9 globale accrue du nouveau variant pour les cellules humaines signifie que si vous respirez cette souche de la COVID-19, il y a de plus grandes chances d\u2019infection car elle se lie plus facilement aux cellules. En outre, il semble \u00e9galement que ce variant est meilleure pour \u00e9chapper au syst\u00e8me immunitaire, ce qui signifie que les m\u00e9canismes de d\u00e9fense standard ne seront pas aussi efficaces.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Cette nouvelle souche affecte-t-elle la d\u00e9tection du virus ?<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Certains laboratoires de diagnostic au Royaume-Uni ont signal\u00e9 que la d\u00e9l\u00e9tion 69-70del dans la prot\u00e9ine de&nbsp;spicule provoque des r\u00e9sultats n\u00e9gatifs aux tests RT-PCR pour le g\u00e8ne S. Cependant, les essais ciblant ce g\u00e8ne sp\u00e9cifique ne sont pas largement utilis\u00e9s pour la d\u00e9tection primaire. Un seul essai ciblant le g\u00e8ne S figure sur la liste des essais publi\u00e9s par l\u2019OMS. \u00c9tant donn\u00e9 que les mutations sont plus susceptibles de se produire dans ce g\u00e8ne, il n\u2019est pas recommand\u00e9 de se fier uniquement au g\u00e8ne S pour la d\u00e9tection primaire de l\u2019infection par le SRAS-CoV-2.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Les vaccins prot\u00e9geront ils contre ce variant?<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Il n\u2019existe actuellement aucune preuve que les vaccins actuellement d\u00e9ploy\u00e9s ne prot\u00e9geraient pas la population contre la nouvelle souche. Les scientifiques affirment qu\u2019un changement dans l\u2019efficacit\u00e9 des vaccins est peu probable. Cependant, il n\u2019existe pas encore de donn\u00e9es sur la capacit\u00e9 des anticorps induits par les vaccins en cours de d\u00e9veloppement \u00e0 neutraliser ce variant. D\u2019autres recherches en laboratoire sont en cours pour obtenir une caract\u00e9risation ph\u00e9notypique d\u00e9taill\u00e9e de la nouvelle souche, et les r\u00e9sultats sont attendus dans les prochaines semaines.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Sources<\/strong><\/p>\n\n\n\n<ol class=\"wp-block-list\">\n<li><a href=\"https:\/\/www.ecdc.europa.eu\/sites\/default\/files\/documents\/SARS-CoV-2-variant-multiple-spike-protein-mutations-United-Kingdom.pdf\">https:\/\/www.ecdc.europa.eu\/sites\/default\/files\/documents\/SARS-CoV-2-variant-multiple-spike-protein-mutations-United-Kingdom.pdf<\/a><\/li>\n\n\n\n<li><a href=\"https:\/\/virological.org\/t\/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations\/563\">https:\/\/virological.org\/t\/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations\/563<\/a><\/li>\n\n\n\n<li><a href=\"https:\/\/www.cdc.gov\/coronavirus\/2019-ncov\/transmission\/variant.html\">https:\/\/www.cdc.gov\/coronavirus\/2019-ncov\/transmission\/variant.html<\/a><\/li>\n\n\n\n<li><a href=\"https:\/\/virological.org\/t\/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations\/563\">https:\/\/virological.org\/t\/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations\/563<\/a><\/li>\n<\/ol>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Le virus \u00e0 l\u2019origine de la COVID-19, le SRAS-CoV-2, est un type de coronavirus, une grande famille de virus portant ce nom en raison des pointes \u00e0 leur surface faisant penser \u00e0 une couronne. 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