{"id":263,"date":"2021-04-12T17:24:33","date_gmt":"2021-04-12T17:24:33","guid":{"rendered":"https:\/\/galenvs.com\/?post_type=news-articles&p=263"},"modified":"2023-08-13T11:54:37","modified_gmt":"2023-08-13T11:54:37","slug":"automated-nucleic-acid-extraction-platforms","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/2021\/04\/12\/automated-nucleic-acid-extraction-platforms\/","title":{"rendered":"Plateformes automatis\u00e9es d\u2019extraction d\u2019acides nucl\u00e9iques"},"content":{"rendered":"\n

L\u2019extraction des acides nucl\u00e9iques est la premi\u00e8re \u00e9tape dans de nombreuses applications cliniques et de recherche.1<\/sup> Des syst\u00e8mes multiplex \u00e0 haut d\u00e9bit ont \u00e9t\u00e9 introduits pour le g\u00e9notypage, l\u2019expression g\u00e9nique et le profilage \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique qui n\u00e9cessitent l\u2019extraction de nombreux \u00e9chantillons d\u2019acide nucl\u00e9ique comme mati\u00e8re de d\u00e9part. Les r\u00e9sultats obtenus \u00e0 l\u2019aide de ces approches ont de vastes implications, tant pour la recherche fondamentale que pour le diagnostic et le suivi des cas cliniques.<\/p>\n\n\n\n

Les proc\u00e9dures manuelles d\u2019extraction des acides nucl\u00e9iques sont bien \u00e9tablies, mais elles exigent beaucoup de temps et d\u2019efforts.2<\/sup> C\u2019est pourquoi il est urgent de mettre au point des m\u00e9thodes optimis\u00e9es d\u2019extraction, \u00e0 partir d\u2019\u00e9chantillons qui exigent moins d\u2019efforts et de temps de la part du personnel de laboratoire. Les plateformes d\u2019extraction automatis\u00e9es d\u2019acides nucl\u00e9iques ont connu un d\u00e9veloppement rapide et repr\u00e9sentent une alternative aux m\u00e9thodes d\u2019extraction manuelles3,4,5<\/sup>.<\/p>\n\n\n\n

Normes de qualit\u00e9 pour les plateformes d\u2019extraction automatis\u00e9es<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Tout au long du processus de d\u00e9veloppement, les plateformes d\u2019extraction automatis\u00e9es sont rigoureusement test\u00e9es pour la lin\u00e9arit\u00e9 et la fiabilit\u00e9 de l\u2019extraction.3,4,5<\/sup> De plus, leur rendement d\u2019extraction est quantifi\u00e9 et compar\u00e9 au rendement des proc\u00e9dures d\u2019extraction manuelles. La puret\u00e9 des acides nucl\u00e9iques extraits, qui est n\u00e9cessaire pour assurer leur bon fonctionnement dans les applications en aval, est \u00e9galement test\u00e9e.2<\/sup><\/p>\n\n\n\n

Avanc\u00e9es dans le d\u00e9veloppement de plateformes d\u2019extraction automatis\u00e9es<\/strong><\/p>\n\n\n\n

La mise en place de syst\u00e8mes automatis\u00e9s d\u2019extraction d\u2019acide nucl\u00e9ique, de syst\u00e8mes de manipulation des liquides et de puces microfluidiques a permis d\u2019effectuer des recherches avanc\u00e9es sur l\u2019extraction d\u2019acide nucl\u00e9ique et d\u2019en tirer des applications cliniques.<\/p>\n\n\n\n

Syst\u00e8mes automatis\u00e9s d\u2019extraction d\u2019acide nucl\u00e9ique<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Plusieurs syst\u00e8mes automatis\u00e9s d\u2019extraction d\u2019acide nucl\u00e9ique bas\u00e9s principalement sur des m\u00e9thodes de billes en phase solide ou magn\u00e9tique ont \u00e9t\u00e9 mis au point.1,3,4,5<\/sup> Les principaux avantages des syst\u00e8mes d\u2019extraction automatis\u00e9s introduits dans la pratique comprennent la vitesse d\u2019extraction et la possibilit\u00e9 de traiter de grands lots d\u2019\u00e9chantillons simultan\u00e9ment. Toutefois, des compromis par rapport aux syst\u00e8mes manuels pourraient poser probl\u00e8mes, tant au niveau de la puret\u00e9 de l\u2019acide nucl\u00e9ique que du temps n\u00e9cessaire pour mettre en place le syst\u00e8me d\u2019extraction et les \u00e9chantillons6<\/sup>.<\/p>\n\n\n\n

Syst\u00e8mes automatis\u00e9s de manutention des liquides<\/strong><\/p>\n\n\n\n

La manipulation des liquides est un aspect difficile du processus d\u2019extraction de l\u2019acide nucl\u00e9ique2<\/sup>. Par cons\u00e9quent, des syst\u00e8mes automatis\u00e9s de manipulation des liquides ont \u00e9galement \u00e9t\u00e9 mis au point et syst\u00e9matiquement mis en \u0153uvre dans les laboratoires de recherche et les laboratoires cliniques. Ces robots de manipulation de liquides distribuent des volumes pr\u00e9cis de r\u00e9actifs ou d\u2019\u00e9chantillons et permettent la manipulation simultan\u00e9e de multiples \u00e9chantillons et leur traitement rapide. Les lecteurs de codes-barres sont un \u00e9l\u00e9ment important de ces syst\u00e8mes puisqu\u2019ils assurent la tra\u00e7abilit\u00e9 des \u00e9chantillons. Dans l\u2019ensemble, les syst\u00e8mes automatis\u00e9s de manutention des liquides facilitent l\u2019automatisation de diff\u00e9rentes proc\u00e9dures de laboratoire, y compris l\u2019extraction d\u2019acides nucl\u00e9iques1<\/sup>.<\/p>\n\n\n\n

Puces microfluidiques
<\/strong>
L\u2019extraction d\u2019acide nucl\u00e9ique n\u00e9cessite g\u00e9n\u00e9ralement de l\u2019\u00e9quipement sp\u00e9cialis\u00e9, des installations sp\u00e9cifiques et du personnel form\u00e9, qui peuvent ne pas \u00eatre facilement disponibles \u00e0 certains endroits. Cependant, la vitesse \u00e0 laquelle l\u2019extraction d\u2019acides nucl\u00e9iques ainsi que les applications en aval peuvent \u00eatre effectu\u00e9es est importante, en particulier pour l\u2019analyse d\u2019\u00e9chantillons cliniques. Le d\u00e9veloppement de plateformes au point de service permet d\u2019effectuer l\u2019extraction d\u2019acides nucl\u00e9iques et les applications en aval sans avoir besoin d\u2019installations sp\u00e9cialis\u00e9es et \u00e0 l\u2019endroit o\u00f9 les d\u00e9cisions cliniques sont prises. Comme \u00e9tape dans cette direction, des puces microfluidiques qui sont bas\u00e9es sur l\u2019extraction en phase solide et qui contiennent tous les r\u00e9actifs n\u00e9cessaires sur les chambres int\u00e9rieures ont \u00e9t\u00e9 introduites1<\/sup>. Toutefois, elles ne satisfont toujours pas aux exigences d\u2019une m\u00e9thode d\u2019extraction au point de service, d\u2019autant plus que les proc\u00e9dures actuelles de pr\u00e9paration des \u00e9chantillons ne sont pas adapt\u00e9es \u00e0 l\u2019environnement au point de service1<\/sup>.<\/p>\n\n\n\n

Tendances dans le d\u00e9veloppement de plateformes d\u2019extraction automatis\u00e9es<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Les plateformes automatis\u00e9es d\u2019extraction d\u2019acides nucl\u00e9iques ont trouv\u00e9 de vastes applications dans les laboratoires de recherche et les cliniques. Les orientations futures dans leur d\u00e9veloppement incluent la miniaturisation des dispositifs et la simplification de leur manipulation. De plus, le d\u00e9veloppement de syst\u00e8mes d\u2019extraction pouvant \u00eatre utilis\u00e9s comme dispositifs au point de service pr\u00e9sente un int\u00e9r\u00eat particulier en raison de leurs implications cliniques importantes, en particulier dans les contextes o\u00f9 les ressources sont limit\u00e9es.<\/p>\n\n\n\n

Sources:<\/strong><\/p>\n\n\n\n

    \n
  1. Ali N, Rampazzo RCP, Costa ADT, Krieger MA. Current nucleic acid extraction methods and their implications to point-of-care diagnostics. Biomed Res Int. 2017;2017:9306564.<\/li>\n\n\n\n
  2. Tan SC, Yiap BC. DNA, RNA, and protein extraction: the past and the present. J Biomed Biotechnol. 2009;2009:574398. doi: 10.1155\/2009\/574398. Erratum in: J Biomed Biotechnol. 2013;2013:628968.<\/li>\n\n\n\n
  3. Verheyen J, Kaiser R, Bozic M, Timmen-Wego M, Maier BK, Kessler HH. Extraction of viral nucleic acids: comparison of five automated nucleic acid extraction platforms. J Clin Virol. 2012;54(3):255-259.<\/li>\n\n\n\n
  4. Perandin F, Pollara PC, Gargiulo F, Bonfanti C, Manca N. Performance evaluation of the automated NucliSens easyMAG nucleic acid extraction platform in comparison with QIAamp Mini kit from clinical specimens. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009;64(2):158-165.<\/li>\n\n\n\n
  5. Lewandowski K, Bell A, Miles R, Carne S, Wooldridge D, Manso C, Hennessy N, Bailey D, Pullan ST, Gharbia S, Vipond R. The effect of nucleic acid extraction platforms and sample storage on the integrity of viral RNA for use in whole genome sequencing. J Mol Diagn. 2017;19(2):303-312.<\/li>\n\n\n\n
  6. Thatcher SA. DNA\/RNA preparation for molecular detection. Clin Chem. 2015;61(1):89-99.<\/li>\n<\/ol>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    L\u2019extraction des acides nucl\u00e9iques est la premi\u00e8re \u00e9tape dans de nombreuses applications cliniques et de recherche.1 Des syst\u00e8mes multiplex \u00e0 haut d\u00e9bit ont \u00e9t\u00e9 introduits pour le g\u00e9notypage, l\u2019expression g\u00e9nique et le profilage \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique qui n\u00e9cessitent l\u2019extraction de nombreux \u00e9chantillons d\u2019acide nucl\u00e9ique comme mati\u00e8re de d\u00e9part. Les r\u00e9sultats obtenus \u00e0 l\u2019aide de ces approches ont de vastes […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":262,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"content-type":"","_uag_custom_page_level_css":"","footnotes":""},"categories":[],"tags":[],"class_list":["post-263","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry"],"uagb_featured_image_src":{"full":["https:\/\/galenvs.com\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/istockphoto-1265123180-612x612-1.jpg",612,408,false],"thumbnail":["https:\/\/galenvs.com\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/istockphoto-1265123180-612x612-1-150x150.jpg",150,150,true],"medium":["https:\/\/galenvs.com\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/istockphoto-1265123180-612x612-1-300x200.jpg",300,200,true],"medium_large":["https:\/\/galenvs.com\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/istockphoto-1265123180-612x612-1.jpg",612,408,false],"large":["https:\/\/galenvs.com\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/istockphoto-1265123180-612x612-1.jpg",612,408,false],"1536x1536":["https:\/\/galenvs.com\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/istockphoto-1265123180-612x612-1.jpg",612,408,false],"2048x2048":["https:\/\/galenvs.com\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/istockphoto-1265123180-612x612-1.jpg",612,408,false]},"uagb_author_info":{"display_name":"galenvs","author_link":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/author\/galenvs\/"},"uagb_comment_info":0,"uagb_excerpt":"L\u2019extraction des acides nucl\u00e9iques est la premi\u00e8re \u00e9tape dans de nombreuses applications cliniques et de recherche.1 Des syst\u00e8mes multiplex \u00e0 haut d\u00e9bit ont \u00e9t\u00e9 introduits pour le g\u00e9notypage, l\u2019expression g\u00e9nique et le profilage \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique qui n\u00e9cessitent l\u2019extraction de nombreux \u00e9chantillons d\u2019acide nucl\u00e9ique comme mati\u00e8re de d\u00e9part. Les r\u00e9sultats obtenus \u00e0 l\u2019aide de ces approches ont de vastes\u2026","_links":{"self":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/263","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=263"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/263\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/262"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=263"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=263"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=263"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}