{"id":259,"date":"2021-04-30T17:22:12","date_gmt":"2021-04-30T17:22:12","guid":{"rendered":"https:\/\/galenvs.com\/?post_type=news-articles&p=259"},"modified":"2023-08-13T12:18:11","modified_gmt":"2023-08-13T12:18:11","slug":"loop-mediated-isothermal-amplification-lamp-principle-and-applications","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/2021\/04\/30\/loop-mediated-isothermal-amplification-lamp-principle-and-applications\/","title":{"rendered":"L\u2019amplification isotherme \u00e0 m\u00e9diation par boucle (LAMP)- Principes et Applications"},"content":{"rendered":"\n

Les techniques de diagnostic mol\u00e9culaire utilisant des acides nucl\u00e9iques ont \u00e9t\u00e9 mises au point gr\u00e2ce \u00e0 la r\u00e9action en cha\u00eene par polym\u00e9rase (PCR), qui est la technique pr\u00e9dominante en raison de sa familiarit\u00e9, de sa sensibilit\u00e9 et de sa robustesse.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Que signifie \u00ab\u00a0PCR\u00a0\u00bb et pourquoi tout le monde en parle ?<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

La r\u00e9action en cha\u00eene par polym\u00e9rase (PCR) est une technique utilis\u00e9e pour \u00ab amplifier \u00bb ou faire de nombreuses copies de petits segments d\u2019ADN, permettant aux scientifiques de faire des recherches g\u00e9n\u00e9tiques approfondies et aux cliniciens de d\u00e9tecter une vari\u00e9t\u00e9 de maladies. Cette m\u00e9thode est extr\u00eamement utile dans le diagnostic des troubles g\u00e9n\u00e9tiques, la prise d\u2019empreintes g\u00e9n\u00e9tiques et la d\u00e9tection de virus ou de bact\u00e9ries. Pourtant, l\u2019utilisation croissante des techniques de diagnostic mol\u00e9culaire a soulign\u00e9 la simplicit\u00e9 et la vitesse comme facteurs cl\u00e9s pour l\u2019adoption de diff\u00e9rentes m\u00e9thodes, en particulier dans les param\u00e8tres de diagnostic \u00e0 petite \u00e9chelle.
Pour les applications sur le terrain et au point de service, les techniques d\u2019amplification isotherme pourraient remplir avec succ\u00e8s ces crit\u00e8res. Dans les m\u00e9thodes d\u2019amplification isotherme, il n\u2019y a pas besoin d\u2019\u00e9quipement de cycle thermique co\u00fbteux. En fait, ces m\u00e9thodes ne n\u00e9cessitent qu\u2019une seule temp\u00e9rature. Par cons\u00e9quent, les r\u00e9actions d\u2019amplification pourraient \u00eatre accomplies en seulement 5 minutes.<\/p>\n\n\n\n

Applications des techniques d\u2019amplification isotherme<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

L\u2019amplification isotherme \u00e0 m\u00e9diation par boucle (LAMP) est la m\u00e9thode isotherme la plus r\u00e9pandue. Elle est appliqu\u00e9e aux diagnostique pour la d\u00e9tection d\u2019agents pathog\u00e8nes dans les aliments, les animaux, les v\u00e9g\u00e9taux et les \u00e9chantillons cliniques. Par exemple, en 2011, Zhang et ses coll\u00e8gues ont utilis\u00e9 LAMP pour d\u00e9tecter les Salmonella spp. avec une sensibilit\u00e9 \u00e9lev\u00e9e dans les l\u00e9gumes. L\u2019ann\u00e9e suivante, Wang et ses coll\u00e8gues ont analys\u00e9 la toxine shiga produisant E. coli (STEC) \u00e0 l\u2019aide de tests LAMP pour le b\u0153uf hach\u00e9, les \u00e9pinards, les parures de b\u0153uf et la laitue.<\/p>\n\n\n\n

Le principe de l\u2019amplification isotherme \u00e0 m\u00e9diation par boucle<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

LAMP, qui se base sur le d\u00e9placement automatique des brins d\u2019ARN ou d\u2019ADN, se compose de deux \u00e9tapes principales :<\/p>\n\n\n\n

    \n
  1. Dans la premi\u00e8re \u00e9tape, quatre amorces sont sp\u00e9cialement con\u00e7ues pour former une structure en forme d\u2019halt\u00e8re.<\/li>\n\n\n\n
  2. Dans la deuxi\u00e8me \u00e9tape, cette structure en forme d\u2019halt\u00e8re est utilis\u00e9e comme mod\u00e8le pour d\u2019autres cycles d\u2019amplification qui proc\u00e8dent \u00e0 la synth\u00e8se d\u2019ADN amorc\u00e9e avec les deux amorces internes.<\/li>\n<\/ol>\n\n\n\n

    Les deux amorces internes de LAMP sont con\u00e7ues de mani\u00e8re \u00e0 former une structure en boucle chaque fois qu\u2019un seul brin est produit. Ces deux amorces internes se composent de deux ensembles de s\u00e9quences qui peuvent lier \u00e0 la fois les brins sensoriels et antisens, avec un espaceur TTTT entre les ensembles de s\u00e9quence.
    Les deux amorces ext\u00e9rieures aident \u00e0 initier la synth\u00e8se d\u2019ADN \/ ARN de d\u00e9placement de brin pour faire la structure de boucle \u00e0 une extr\u00e9mit\u00e9. Pour am\u00e9liorer la vitesse de r\u00e9action, deux amorces optionnelles, LF (boucle avant) et LB (boucle arri\u00e8re), peuvent \u00e9galement \u00eatre ajout\u00e9es \u00e0 la r\u00e9action d\u2019amplification.<\/p>\n\n\n\n

    Les avantages de LAMP<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

    Sources:<\/strong><\/p>\n\n\n\n

    Tanner, Nathan A., and Thomas C. Evans Jr. \u00ab Loop\u2010mediated isothermal amplification for detection of nucleic acids. \u00bb Current protocols in molecular biology<\/em> 105.1 (2014): 15-14.<\/p>\n\n\n\n

    Notomi, Tsugunori, et al. \u00ab Loop-mediated isothermal amplification of DNA. \u00bb Nucleic acids research<\/em> 28.12 (2000): e63-e63.<\/p>\n\n\n\n

    Dolka, Beata, Agata Anna Cisek, and Piotr Szeleszczuk. \u00ab The application of the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for diagnosing Enterococcus hirae-associated endocarditis outbreaks in chickens. \u00bb BMC microbiology<\/em> 19.1 (2019): 1-13.<\/p>\n\n\n\n

    Zhang, Guodong, Eric W. Brown, and Narjol Gonz\u00e1lez-Escalona. \u00ab Comparison of real-time PCR, reverse transcriptase real-time PCR, loop-mediated isothermal amplification, and the FDA conventional microbiological method for the detection of Salmonella spp. in produce. \u00bb Applied and environmental microbiology<\/em> 77.18 (2011): 6495-6501.<\/p>\n\n\n\n

    Wang, Fei, et al. \u00ab Rapid and specific detection of Escherichia coli serogroups O26, O45, O103, O111, O121, O145, and O157 in ground beef, beef trim, and produce by loop-mediated isothermal amplification. \u00bb Applied and environmental microbiology<\/em> 78.8 (2012): 2727-2736<\/p>\n\n\n\n

    Zhang, Wei, et al. \u00ab Application of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for the rapid diagnosis of pathogenic bacteria in clinical sputum specimens of acute exacerbation of COPD (AECOPD). \u00bb International journal of clinical and experimental medicine<\/em> 8.5 (2015): 7881.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    Les techniques de diagnostic mol\u00e9culaire utilisant des acides nucl\u00e9iques ont \u00e9t\u00e9 mises au point gr\u00e2ce \u00e0 la r\u00e9action en cha\u00eene par polym\u00e9rase (PCR), qui est la technique pr\u00e9dominante en raison de sa familiarit\u00e9, de sa sensibilit\u00e9 et de sa robustesse. Que signifie \u00ab\u00a0PCR\u00a0\u00bb et pourquoi tout le monde en parle ? La r\u00e9action en cha\u00eene […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":258,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[],"tags":[],"class_list":["post-259","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/259","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=259"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/259\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/258"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=259"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=259"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/galenvs.com\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=259"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}